Тема Гулага представлена в постоянной экспозиции музея двумя тематическими стендами. Первый стенд – «Репрессии 30-х» – содержит биографические материалы арестованных и высланных жителей Анжеро-Судженска (фотографии, документы). Второй посвящен истории депортаций в Анжеро-Судженск, судьбам спецпоселенцев. В витринах выставлены современные фотографии лагерных объектов, предметы, найденные на местах дислокации бывших лагпунктов Анжеро-Судженского отделения, воспоминания и биографические материалы заключенных. Кроме того, тема присутствует на стендах, посвященных истории города и области: «Гражданская война», «Анжеро-Судженская часть особого назначения» (о подавлении крестьянского вооруженного выступления под предводительством П.К.Лубкова), «Коллективизация».
В 1995 году была открыта временная выставка к 50-летию победы в Великой Отечественной войне – «Оборотная сторона победы» – о депортациях, трудармии, спецпоселенцах, лагерях во время войны. После окончания выставки часть материалов осталась в постоянной экспозиции. В настоящее время часть постоянной экспозиции этнографического зала «Сплетение судеб» рассказывает о появлении в районе раскулаченных спецпереселенцев из Башкирии (1931), немцах-спецпереселенцах, трудармейцах и др.
Целенаправленный сбор материалов по теме был предпринят в начале 1990-х годов по инициативе бывшего сотрудника музея Н.П.Голдаевой. Комплектование ведется за счет работы в государственных архивах и накопления персональных фондов, а также в экспедициях музея (иногда совместно с городской гимназией №11) по местам дислокации лагпунктов в Яйском и Ижморском районах Кемеровской области. Музей проводит фотофиксацию лагерных объектов и мест захоронений. Фонды музея по теме насчитывают более 500 ед. хр. по истории Гулага – предметы лагерного быта, личные фотографии, вещи и документы спецпоселенцев (находятся на общем хранении, сгруппированы в тематических папках и персональных фондах бывших жителей Анжеро-Судженска, заключенных и спецпоселенцев), предметы с территории бывших лагпунктов Анжеро-Судженского отделения. В фондах хранятся копии документов по лагерю военнопленных №503 на территории Анжеро-Судженска, в том числе: список умерших военнопленных лаготделения №9, схемы кладбища лаготделения №11 (немцев и интернированных) и лаготделения №8, фотографии сотрудников лагеря. Составлена «Схема размещения лагерных отделений и спецкомендатур г.Анжеро-Судженск», на которую нанесены также известные места лагерных кладбищ.
