Историю Гулага музей представляет временными выставками, полностью или частично посвященными лагерям и ссылке в Республике Коми. С 1990 года проведено 12 таких выставок: «Коми край (область, АССР) в 1917-1941 годах» (1990-1991), «Политические репрессии 1930-х, - начала 1950-х годов» (1990-1991), фотовыставка «ГУЛАГ в Коми» (1994), «10 лет Сыктывкарскому "Мемориалу"» (1999), передвижная выставка «Немцы в Республике Коми» (2000), «В поисках Эльдорадо» (2002-2003), «"Я разделил судьбу страны:" (детям ГУЛАГа посвящается)» (2002-2003), «Воркута-Ленинград. История сопротивления в зеркале Коми в 50-х - 80-х годах» (2003), «Неизвестный Налимов» (2004), «Сквозь замки проходят музы» (с 2004), «Женский портрет в интерьере эпохи. ХХ век» (2004) и другие. Фрагменты большинства выставок остаются в постоянной экспозиции и образуют «гулаговскую» составляющую истории края. С 2001 года ежегодно 30 октября проводятся экспресс-выставки, посвященные истории репрессий. Разработана научная концепция музейного проекта «Между строк: история в письмах, дневниках, воспоминаниях. 1929-1959 годы», выставка предполагает электронный вариант.
Фонды музея содержат материалы по истории Гулага, ссылки, спецпоселений и трудколонн в Коми крае: письма, документы, фотографии из личных архивов, копии документов из центральных и республиканских архивов, предметы быта заключенных и спецпоселенцев, коллекцию созданных ими произведений искусства (живопись, графика, плакат). Тематически эти материалы не выделены и находятся на общем хранении. Многие из них содержатся в персональных фондах и коллекциях документов различных производств, сформированных еще в советское время; часть экспонатов была собрана в процессе экспедиции сотрудников Музея в поселок Вожаель (местонахождение Управления Устьвымлага) в 1989 году. Среди них лагерные атрибуты и предметы быта: решетки, двери, котелки, миски, формы для выпечки хлеба, а также фотографии лагерных объектов и мест захоронений. Документальные фонды постоянно пополняются материалами, выявляемыми в Национальном и других республиканских архивах.
