В 1989 году постоянная экспозиция «Воркута заполярная. История города» впервые пополнилась экспонатами, отражающими лагерное прошлое Воркуты: копиями документов и фотографий из республиканских архивов, в том числе архивов органов госбезопасности. Изучение и представление гулаговского периода становления города превратилось в одно из приоритетных направлений работы музея.
В музее создаются временные выставки, связанные с лагерной тематикой: «История одной семьи» и др.; некоторые из этих выставок, например, «Жизнь после смерти» (2000), посвященная судьбе заключенных после освобождения, реализации ими творческого и научного потенциала, - также вошли в постоянную экспозицию.
Фондовая коллекция по теме «История Воркутлага» в настоящее время содержит 1700 ед. хр. (в основном фонде - 538, в научно-вспомогательном - 1184). Большая часть из них документы и фотографии. В вещевом фонде хранятся личные вещи узников Воркутлага, «лагерная археология» - предметы, найденные на местах бывших ОЛП, шахматы, сделанные из хлебного мякиша, и т.д. Имеется значительная (около 700 ед. хр.) коллекция произведений изобразительного искусства, созданных узниками Воркутлага как в заключении, так и после освобождения (графика, живопись, самодельные открытки); уникальная подборка театральных афиш и программ Воркутинского музыкально-драматического театра, коллектив которого состоял в основном из заключенных; подшивка газеты «Заполярная кочегарка».
Предметы лагерного быта, хранящиеся в музее, были представлены на международных выставках в Лейпциге (1999) и Бонне (2004), музей принимает участие в российско-германском выставочном проекте «Spuren. Немцы и русские в истории».
Ведется переписка с бывшими заключенными. По обращениям родственников и друзей бывших заключенных воркутинских лагерей Музей осуществляет поиск сведений об их судьбах. В музее проводятся экскурсии, лекции и беседы: «Люди Воркутлага», «Любовь и дети за колючей проволокой», «Театр Гулага». Музей участвует в проведении ежегодных Дней памяти 30 октября и 1 августа (дата расстрела в 1953 году забастовавших заключенных Юр-Шора). Для городского сайта подготовлена и открыта страница «Люди и судьбы».
